Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF1Q9Y548 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.4 ms