Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT8Q9UFF9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms