Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms