Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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