Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms