Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3Q99687 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms