Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms