Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
B4GALNT3Q6L9W6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
B4GALNT3Q6L9W6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms