Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM78Q5T7P6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms