Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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