Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.511e-6■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.591e-6■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 KMT2C-206ENST00000424877 5874 ntTSL 56.86□□□□□ -1.314e-6■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.916e-6■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.96e-6■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.576e-6■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 213.87□□□□□ -0.196e-6■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.322e-7■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.147e-10■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.317e-10■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 KIF20A-202ENST00000502338 600 ntTSL 34.94□□□□□ -1.627e-10■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.169e-7■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.215e-7■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.215e-7■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.175e-7■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 SUGP2-213ENST00000600239 5565 ntTSL 216.07■□□□□ 0.165e-7■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.045e-7■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 SUGP2-206ENST00000594773 4169 ntTSL 210.66□□□□□ -0.75e-7■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 SUGP2-201ENST00000330854 3629 ntTSL 1 (best)10.42□□□□□ -0.745e-7■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 FILIP1L-207ENST00000476723 567 ntTSL 416.35■□□□□ 0.217e-10■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.197e-10■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.367e-10■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.417e-10■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.577e-10■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.97e-10■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 FILIP1L-210ENST00000495625 2898 ntTSL 1 (best)12.56□□□□□ -0.47e-10■□□□□ 11.2
HLTFQ14527 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.985e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.275e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RSF1-211ENST00000532556 495 ntTSL 36.69□□□□□ -1.345e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.385e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.415e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RSF1-205ENST00000526324 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)4.12□□□□□ -1.755e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 ZNF761-201ENST00000334095 3681 ntTSL 23.99□□□□□ -1.775e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.044e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 DST-232ENST00000524186 569 ntTSL 413.58□□□□□ -0.249e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 05e-8■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 CDK12-209ENST00000584632 4165 ntTSL 515.03■□□□□ -05e-8■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.155e-8■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 WDR59-214ENST00000568323 558 ntTSL 517.29■□□□□ 0.362e-19■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 WDR59-211ENST00000564859 488 ntTSL 316.09■□□□□ 0.172e-19■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 WDR59-208ENST00000563111 583 ntTSL 410.96□□□□□ -0.652e-19■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 WDR59-204ENST00000562331 570 ntTSL 410.35□□□□□ -0.752e-19■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 MED1-203ENST00000577831 4584 ntTSL 210.1□□□□□ -0.794e-9■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.544e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 GPBP1L1-214ENST00000498128 559 ntTSL 310.14□□□□□ -0.794e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.94e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC7.13□□□□□ -1.274e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.637e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.81■□□□□ 0.447e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.347e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.337e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.267e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.127e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RPS13-203ENST00000525828 664 ntTSL 217.18■□□□□ 0.349e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RPS13-204ENST00000526895 561 ntTSL 314.39□□□□□ -0.119e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RPS13-209ENST00000533969 355 ntTSL 313.65□□□□□ -0.229e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.749e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.929e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 RPS13-208ENST00000531908 746 ntTSL 26.32□□□□□ -1.49e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.61□□□□□ -1.839e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 SLC22A23-207ENST00000467177 1221 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.112e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 SLC22A23-209ENST00000485307 1574 ntTSL 1 (best)14.12□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 SLC22A23-206ENST00000467144 542 ntTSL 413.48□□□□□ -0.252e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 SLC22A23-211ENST00000496753 561 ntTSL 411.84□□□□□ -0.512e-7■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.752e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 TBCK-204ENST00000394708 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.482e-8■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 TBCK-202ENST00000361687 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-8■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-8■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.782e-8■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 TBCK-206ENST00000467183 3566 ntTSL 1 (best)9.48□□□□□ -0.892e-8■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.522e-8■□□□□ 11.1
HLTFQ14527 ZNF638-215ENST00000472758 535 ntTSL 34.21□□□□□ -1.742e-8■□□□□ 11
HLTFQ14527 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.524e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 KNOP1-203ENST00000565844 1394 ntTSL 515.33■□□□□ 0.044e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.074e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 KNOP1-204ENST00000567367 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.3□□□□□ -0.444e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 GTF3C2-201ENST00000264720 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.554e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 GTF3C2-202ENST00000359541 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.794e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 GTF3C2-210ENST00000480989 604 ntTSL 49.36□□□□□ -0.914e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.074e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.364e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 LINC01091-202ENST00000511919 590 ntTSL 36.51□□□□□ -1.374e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 USP34-211ENST00000472706 556 ntTSL 45.47□□□□□ -1.532e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.184e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.74e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 ROCK2-204ENST00000431087 729 ntTSL 36.73□□□□□ -1.336e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.355e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 523.38■■□□□ 1.335e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 SCAF11-211ENST00000547950 697 ntTSL 26.68□□□□□ -1.346e-8■□□□□ 11
HLTFQ14527 TFPI-212ENST00000481389 599 ntTSL 54.22□□□□□ -1.737e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 SHANK2-216ENST00000482659 381 ntTSL 34.47□□□□□ -1.692e-6■□□□□ 11
HLTFQ14527 CYTH2-201ENST00000325139 1087 ntTSL 224.91■■□□□ 1.583e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 CYTH2-202ENST00000391881 1546 ntTSL 522.28■■□□□ 1.163e-7■□□□□ 11
HLTFQ14527 NINL-206ENST00000489780 630 ntTSL 319.36■□□□□ 0.694e-9■□□□□ 11
HLTFQ14527 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.693e-7■□□□□ 11
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