Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM29Q14134 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM29Q14134 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms