Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTF3Q12996 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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