Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms