Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTX3P26022 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTX3P26022 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTX3P26022 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTX3P26022 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTX3P26022 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTX3P26022 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTX3P26022 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTX3P26022 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTX3P26022 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTX3P26022 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTX3P26022 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTX3P26022 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTX3P26022 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTX3P26022 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTX3P26022 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms