Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms