Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC2O95347 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC2O95347 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC2O95347 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC2O95347 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC2O95347 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC2O95347 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC2O95347 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC2O95347 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC2O95347 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC2O95347 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC2O95347 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC2O95347 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC2O95347 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC2O95347 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC2O95347 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC2O95347 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC2O95347 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC2O95347 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC2O95347 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC2O95347 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC2O95347 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC2O95347 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC2O95347 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC2O95347 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC2O95347 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC2O95347 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC2O95347 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC2O95347 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC2O95347 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC2O95347 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC2O95347 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC2O95347 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC2O95347 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC2O95347 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms