Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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NDUFS5O43920 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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NDUFS5O43920 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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NDUFS5O43920 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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NDUFS5O43920 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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NDUFS5O43920 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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NDUFS5O43920 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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NDUFS5O43920 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NDUFS5O43920 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NDUFS5O43920 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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