Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms