Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.261e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.281e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 RABGEF1-206ENST00000461017 711 ntTSL 36.73□□□□□ -1.331e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.341e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.361e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SSFA2-213ENST00000491720 6473 ntTSL 26.52□□□□□ -1.371e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PAPD7-204ENST00000514410 575 ntTSL 26.47□□□□□ -1.371e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.371e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 ZFP90-214ENST00000573113 505 ntTSL 26.36□□□□□ -1.391e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.411e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTAGE5-213ENST00000555716 558 ntTSL 46.23□□□□□ -1.416e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTDSP2-208ENST00000552294 436 ntTSL 56.1□□□□□ -1.436e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.456e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DDAH1-203ENST00000483110 3905 ntTSL 1 (best)5.99□□□□□ -1.451e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 GPBP1L1-206ENST00000479235 3121 ntTSL 25.94□□□□□ -1.461e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.476e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.491e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SSFA2-214ENST00000491866 718 ntTSL 55.61□□□□□ -1.511e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.516e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.516e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 GPBP1L1-209ENST00000487436 560 ntTSL 25.6□□□□□ -1.511e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MAGI2-AS3-219ENST00000616192 287 ntTSL 35.53□□□□□ -1.521e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.566e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.576e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.641e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 NREP-211ENST00000504018 653 ntTSL 1 (best)4.71□□□□□ -1.661e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTAGE5-211ENST00000554392 527 ntTSL 44.71□□□□□ -1.666e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SPTAN1-227ENST00000635806 193 ntTSL 54.55□□□□□ -1.681e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 GPBP1L1-205ENST00000468724 559 ntTSL 34.26□□□□□ -1.731e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PPIG-206ENST00000433207 1485 ntTSL 1 (best)4.15□□□□□ -1.756e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MAGI2-AS3-215ENST00000612949 832 ntTSL 53.81□□□□□ -1.81e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 TMEM87B-205ENST00000471632 583 ntTSL 33.73□□□□□ -1.816e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 AKR1C3-208ENST00000603484 629 ntTSL 23.53□□□□□ -1.846e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.881e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.886e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.484e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 TMCO1-205ENST00000476143 581 ntTSL 312.97□□□□□ -0.334e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 TMCO1-202ENST00000392129 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.414e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.494e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 TMCO1-201ENST00000367881 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.634e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 TMCO1-204ENST00000465705 760 ntTSL 511□□□□□ -0.654e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 TMCO1-206ENST00000481278 752 ntTSL 39.58□□□□□ -0.884e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DMXL2-208ENST00000559498 571 ntTSL 56.9□□□□□ -1.34e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 NEMF-206ENST00000555411 573 ntTSL 46.89□□□□□ -1.314e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.574e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.784e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.944e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DMXL2-204ENST00000558124 578 ntTSL 32.92□□□□□ -1.944e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR13-203ENST00000466962 684 ntTSL 315.79■□□□□ 0.129e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 SDE2-201ENST00000272091 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.429e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 WDR13-211ENST00000495575 547 ntTSL 211.98□□□□□ -0.499e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 TTF2-205ENST00000470935 849 ntTSL 510.97□□□□□ -0.659e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 DYNC1H1-203ENST00000554854 721 ntTSL 38.06□□□□□ -1.129e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.389e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 DOT1L-202ENST00000446286 376 ntTSL 315.12■□□□□ 0.018e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-201ENST00000570945 3219 ntTSL 317.02■□□□□ 0.326e-6■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-208ENST00000641175 619 nt15.62■□□□□ 0.096e-6■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.27□□□□□ -0.126e-6■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-204ENST00000634265 892 ntTSL 56.53□□□□□ -1.366e-6■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 TCF25-213ENST00000564957 459 ntTSL 318.54■□□□□ 0.563e-11■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 TCF25-216ENST00000565860 437 ntTSL 318.54■□□□□ 0.563e-11■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 TCF25-218ENST00000566283 515 ntTSL 218.54■□□□□ 0.563e-11■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 TCF25-220ENST00000567171 1535 ntTSL 216.36■□□□□ 0.213e-11■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 NCAPG-203ENST00000510063 807 ntTSL 54.56□□□□□ -1.681e-11■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.113e-41■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 PRKRIP1-207ENST00000482549 1625 ntTSL 1 (best)25.87■■□□□ 1.736e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 PRKRIP1-204ENST00000469763 1642 ntTSL 523.53■■□□□ 1.366e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 PRKRIP1-205ENST00000477886 986 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.136e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.586e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 MELTF-207ENST00000491399 556 ntTSL 216.46■□□□□ 0.236e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 DCAF7-206ENST00000615512 751 ntTSL 514.48□□□□□ -0.096e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 DCAF7-202ENST00000431926 1354 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.156e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.276e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.66e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 TRIO-209ENST00000507714 551 ntTSL 38.89□□□□□ -0.996e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 TRIO-220ENST00000512979 292 ntTSL 58.74□□□□□ -1.016e-9■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.642e-14■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 BTNL9-205ENST00000509395 611 ntTSL 418.14■□□□□ 0.492e-14■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 BTNL9-206ENST00000511056 332 ntTSL 317.24■□□□□ 0.352e-14■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 BTNL9-207ENST00000511589 571 ntTSL 417.24■□□□□ 0.352e-14■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 BTNL9-204ENST00000506782 676 ntTSL 510.85□□□□□ -0.672e-14■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 PAPOLA-217ENST00000555912 2277 ntTSL 28.49□□□□□ -1.052e-17■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 PAPOLA-204ENST00000553461 892 ntTSL 23.88□□□□□ -1.792e-17■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 SLC7A2-206ENST00000640220 2068 ntTSL 1 (best)10.83□□□□□ -0.681e-14■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-14■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-14■□□□□ 8.2
EFTUD2Q15029 SLC39A5-207ENST00000437277 588 ntTSL 417.05■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RNPS1-208ENST00000563857 739 ntTSL 215.21■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SLC39A5-204ENST00000419753 613 ntTSL 313.87□□□□□ -0.191e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SLC39A5-202ENST00000417965 569 ntTSL 412.82□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SLC39A5-205ENST00000424625 559 ntTSL 412.44□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RPS15A-206ENST00000569083 1022 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 PHGDH-228ENST00000641847 692 nt9.33□□□□□ -0.921e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ZMYND8-208ENST00000435836 670 ntTSL 58.61□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 PHGDH-217ENST00000641455 312 nt7.14□□□□□ -1.271e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 GSPT1-209ENST00000567631 678 ntTSL 25.75□□□□□ -1.491e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ZMYND8-210ENST00000446894 341 ntTSL 24.01□□□□□ -1.771e-6■□□□□ 8.1
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