Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms