Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN11Q9UMQ6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms