Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms