Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARVAQ9NVD7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVAQ9NVD7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVAQ9NVD7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVAQ9NVD7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVAQ9NVD7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVAQ9NVD7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVAQ9NVD7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVAQ9NVD7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVAQ9NVD7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms