Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPIP1Q96JH7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms