Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms