Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CFAP47Q6ZTR5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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