Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD5Q5TGI4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD5Q5TGI4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms