Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1TD1Q5T7N2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms