Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms