Protein–RNA interactions for Protein: Q16655

MLANA, Melanoma antigen recognized by T-cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLANAQ16655 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLANAQ16655 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms