Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-32■■□□□ 12.2
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NOLC1Q14978 MYBBP1A-211ENST00000574547 1607 ntTSL 1 (best)19.28■□□□□ 0.682e-8■■□□□ 12.2
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NOLC1Q14978 MYBBP1A-212ENST00000574934 1941 ntTSL 216.77■□□□□ 0.282e-8■■□□□ 12.2
NOLC1Q14978 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-8■■□□□ 12.2
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NOLC1Q14978 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.352e-8■■□□□ 12.2
NOLC1Q14978 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.233e-9■■□□□ 12.2
NOLC1Q14978 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.154e-13■■□□□ 12.1
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NOLC1Q14978 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.224e-13■■□□□ 12.1
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NOLC1Q14978 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.364e-13■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-13■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 ENKD1-207ENST00000602942 1253 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.574e-13■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.861e-6■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 CTNNB1-204ENST00000405570 2513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.575e-6■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.425e-6■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.932e-9■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.881e-6■■□□□ 12.1
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NOLC1Q14978 CCND2-201ENST00000261254 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.481e-6■■□□□ 12.1
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NOLC1Q14978 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -11e-6■■□□□ 12.1
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NOLC1Q14978 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.871e-7■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.351e-32■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-32■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 PSAP-206ENST00000633965 500 ntTSL 58.69□□□□□ -1.029e-12■■□□□ 12.1
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NOLC1Q14978 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.252e-7■■□□□ 12.1
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NOLC1Q14978 UBE2I-214ENST00000566775 396 ntTSL 39.14□□□□□ -0.952e-7■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 RPS27A-207ENST00000471772 557 ntTSL 28.72□□□□□ -1.016e-26■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.032e-6■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.36□□□□□ -2.191e-323■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 EIF4A1-222ENST00000582050 576 ntTSL 519.6■□□□□ 0.731e-323■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 TIMM44-205ENST00000597926 819 ntTSL 319.3■□□□□ 0.685e-10■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.645e-10■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 TIMM44-203ENST00000595831 1797 ntTSL 517.47■□□□□ 0.395e-10■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 TIMM44-204ENST00000595876 1206 ntTSL 1 (best)15.02■□□□□ -05e-10■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 TIMM44-212ENST00000600748 768 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.115e-10■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 EIF4A1-221ENST00000581841 621 ntTSL 210.85□□□□□ -0.671e-323■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.86□□□□□ -1.471e-323■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 SEC23A-205ENST00000553925 484 ntTSL 35.48□□□□□ -1.535e-10■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 EIF4A1-220ENST00000581808 205 ntTSL 34.28□□□□□ -1.721e-323■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 OAZ1-206ENST00000589739 657 ntTSL 219.48■□□□□ 0.711e-7■■□□□ 12.1
NOLC1Q14978 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.811e-6■■□□□ 12
NOLC1Q14978 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.641e-6■■□□□ 12
NOLC1Q14978 CLSTN1-203ENST00000435891 3829 ntTSL 212.27□□□□□ -0.451e-6■■□□□ 12
NOLC1Q14978 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.545e-20■■□□□ 12
NOLC1Q14978 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.155e-20■■□□□ 12
NOLC1Q14978 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.135e-20■■□□□ 12
NOLC1Q14978 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.045e-20■■□□□ 12
NOLC1Q14978 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.055e-20■■□□□ 12
NOLC1Q14978 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.185e-20■■□□□ 12
NOLC1Q14978 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.337e-7■■□□□ 12
NOLC1Q14978 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.337e-7■■□□□ 12
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