Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms