Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms