Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN10P78369 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms