Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD34P28906 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD34P28906 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD34P28906 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD34P28906 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD34P28906 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD34P28906 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD34P28906 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD34P28906 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD34P28906 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD34P28906 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD34P28906 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms