Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F2P24468 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F2P24468 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms