Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF1P18846 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF1P18846 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF1P18846 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF1P18846 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF1P18846 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF1P18846 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF1P18846 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF1P18846 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF1P18846 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF1P18846 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATF1P18846 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF1P18846 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF1P18846 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF1P18846 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF1P18846 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF1P18846 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF1P18846 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF1P18846 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF1P18846 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF1P18846 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms