Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPK2O43353 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPK2O43353 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms