Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
USP17L4A6NCW7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms