Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED16Q9Y2X0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED16Q9Y2X0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms