Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PGPEP1Q9NXJ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms