Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DCLRE1CQ96SD1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DCLRE1CQ96SD1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms