Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPSB1Q96BD6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPSB1Q96BD6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms