Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP35Q8NFH5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms