Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECAB1Q8N987 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECAB1Q8N987 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms