Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZD4Q76G19 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms