Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RSL1D1-206ENST00000572090 759 ntTSL 36.29□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 42.8
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PRPF8Q6P2Q9 ECHDC1-212ENST00000461239 617 ntTSL 56.62□□□□□ -1.351e-10■■■■■ 42.5
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PRPF8Q6P2Q9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.463e-11■■■■■ 42.4
PRPF8Q6P2Q9 SCNN1D-204ENST00000379101 2268 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.683e-11■■■■■ 42.4
PRPF8Q6P2Q9 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-11■■■■■ 42.4
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PRPF8Q6P2Q9 SCNN1D-207ENST00000467651 204 ntTSL 59.06□□□□□ -0.963e-11■■■■■ 42.4
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