Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40Q6AI12 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40Q6AI12 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms