Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms